Also sind Kabel und Kerzen in Ordnung. Das meinten die mit "Dann ist auch die neue Zündspule defekt". Nockenwellensensor hast du ja schon ausgeschlossen. Und wenn das Steuergerät einen Schuß hätte, vermute ich mal, dass dann der Fehler nicht ständig an der gleichen Stelle wäre. Da drin gibt es eigentlich nichts, was irgendwie nach genau 3 Zündungen 1 mal aussetzen könnte.
Bau die Zündspule mal aus und schaue dir den Anschluß von 3 genau an. Muss ja nicht sein, dass die Zündspule gar nicht funkt, sondern evtl., dass es am Anschluß ein Problem gibt.